71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2848 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  100 
 
 		 286 aa  596  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  49.82 
 
 		 271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  46.45 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  47.01 
 
 		 269 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  45.62 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  40.22 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  38.01 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  38.46 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  37.36 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.07 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.77 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  34.3 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  37.31 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.46 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.06 
 
 		 276 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  32.22 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  36.2 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  29.5 
 
 		 694 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  29.14 
 
 		 694 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.46 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  28.42 
 
 		 694 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.78 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.23 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.06 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.06 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.89 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.89 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.89 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.89 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.68 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.68 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  29.89 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.78 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.15 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.2 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.6 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.51 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.79 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.47 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  33.9 
 
 		 269 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.94 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.94 
 
 		 265 aa  85.5  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  24.81 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  21.88 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  23.27 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1927  Cof-like hydrolase  24.38 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  38.24 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0834  HAD superfamily hydrolase  38.89 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.47 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  22.81 
 
 		 279 aa  46.2  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  23.6 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2067  hydrolase  25.1 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.347224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  23.6 
 
 		 273 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  22.81 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3240  hydrolase  25.21 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0554089  normal  0.223166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  22.93 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  30.3 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  36.11 
 
 		 232 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  33.82 
 
 		 233 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  23.85 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  22.05 
 
 		 279 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  24.41 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>