23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2398 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2398  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249611  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  57.69 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  60.82 
 
 		 201 aa  237  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1731  hypothetical protein  58.25 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000442595  normal  0.728518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1811  hypothetical protein  57.49 
 
 		 206 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0129545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  57 
 
 		 206 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2394  hypothetical protein  52.02 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000175566  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2405  hypothetical protein  51.57 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1953  hypothetical protein  51.57 
 
 		 223 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.38277  normal  0.0743494 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2510  hypothetical protein  52.05 
 
 		 219 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0427588  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1675  hypothetical protein  58.37 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1812  hypothetical protein  54.97 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.028303  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1544  hypothetical protein  51.31 
 
 		 194 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00234797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2832  hypothetical protein  52.82 
 
 		 201 aa  200  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000632951  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1331  hypothetical protein  54.17 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.921495  normal  0.485409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1631  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000294763  normal  0.53809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  30.85 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1726  hypothetical protein  27.27 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003993  hypothetical protein  26.42 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.945378  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01529  hypothetical protein  25.52 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3480  hypothetical protein  26.09 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  25.79 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1475  hypothetical protein  21.13 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>