29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2273 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 116 aa  233  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  87.93 
 
 		 116 aa  208  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  83.62 
 
 		 116 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  81.03 
 
 		 116 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  81.9 
 
 		 116 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  73.28 
 
 		 116 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  70.69 
 
 		 116 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  72.41 
 
 		 116 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  62.07 
 
 		 116 aa  157  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  53.45 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  45.13 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  36.27 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  33.9 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  30.77 
 
 		 115 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  31.82 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.36 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  31.62 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.33 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  34.69 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  28.28 
 
 		 221 aa  51.2  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  34 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  28.28 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  28.97 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  31.25 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  29.29 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 		 122 aa  40  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>