52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1220 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  100 
 
 		 697 aa  1437    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  49.47 
 
 		 741 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  48.88 
 
 		 760 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  45.02 
 
 		 749 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  49.47 
 
 		 725 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  44.64 
 
 		 757 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  47.48 
 
 		 769 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  47.8 
 
 		 754 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  43.92 
 
 		 716 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  42.75 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  42.37 
 
 		 768 aa  482  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  40.49 
 
 		 756 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  42.32 
 
 		 756 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  41.6 
 
 		 765 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  34.22 
 
 		 687 aa  270  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  29.28 
 
 		 854 aa  191  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  27.29 
 
 		 900 aa  188  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30 
 
 		 2336 aa  170  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  27.27 
 
 		 1107 aa  159  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  25.44 
 
 		 1109 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  25.38 
 
 		 1605 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  25.06 
 
 		 917 aa  150  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  26.68 
 
 		 2348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.65 
 
 		 2376 aa  147  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  27.27 
 
 		 2276 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  25.93 
 
 		 2391 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  26.17 
 
 		 2396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  26.03 
 
 		 2368 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  26.3 
 
 		 2275 aa  104  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  23.78 
 
 		 2882 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  24.43 
 
 		 3073 aa  73.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2267  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.45 
 
 		 2249 aa  67.4  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  23.12 
 
 		 2314 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  22.19 
 
 		 2553 aa  53.9  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1676  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase, PfaA  19.89 
 
 		 2189 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29560  Type I fatty acid synthase ArsA  21.11 
 
 		 2503 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  23.06 
 
 		 2719 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2905  beta-ketoacyl synthase  21.51 
 
 		 3243 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1668  Beta-ketoacyl synthase  22.58 
 
 		 2614 aa  47.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4747  Beta-ketoacyl synthase  22.6 
 
 		 1272 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0688  polyketide synthase modules and related proteins-like  20.88 
 
 		 2260 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000350416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2879  Beta-ketoacyl synthase  22.19 
 
 		 3115 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4448  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.19 
 
 		 2300 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  21.59 
 
 		 1408 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0462  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  23.5 
 
 		 2414 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  23.12 
 
 		 1602 aa  45.8  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.47 
 
 		 1816 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4238  polyketide-type polyunsaturated fatty acid synthase PfaA  22.17 
 
 		 1845 aa  45.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0135  beta-ketoacyl synthase  20.81 
 
 		 2754 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1962  putative modular PKS system  21 
 
 		 1631 aa  44.3  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0314751  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5615  Beta-ketoacyl synthase  23.75 
 
 		 2816 aa  44.3  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.129905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1437  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  23.9 
 
 		 304 aa  43.9  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>