36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0387 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0387  Y4bN protein  100 
 
 
814 aa  1671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0549817  normal  0.142123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5328  hypothetical protein  35.36 
 
 
829 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1292  hypothetical protein  37.42 
 
 
841 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0886595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4230  hypothetical protein  35.85 
 
 
789 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.828103  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4275  hypothetical protein  38.3 
 
 
826 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2776  subtilisin-like serine protease  34.56 
 
 
830 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.827378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1586  hypothetical protein  35.15 
 
 
847 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2253  subtilisin-like serine protease  36.88 
 
 
823 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3864  hypothetical protein  35.15 
 
 
847 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.000004588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1693  hypothetical protein  36.28 
 
 
830 aa  445  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349675  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3853  hypothetical protein  33.77 
 
 
845 aa  444  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1074  hypothetical protein  35.19 
 
 
825 aa  440  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2676  hypothetical protein  35.55 
 
 
822 aa  436  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.70915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2858  hypothetical protein  34.77 
 
 
835 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0085  hypothetical protein  33.93 
 
 
849 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0321951  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4804  hypothetical protein  35.4 
 
 
831 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4253  hypothetical protein  34.18 
 
 
846 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4893  hypothetical protein  33.42 
 
 
835 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3535  hypothetical protein  30.68 
 
 
850 aa  323  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.692569  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2088  hypothetical protein  32.24 
 
 
847 aa  317  4e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5488  hypothetical protein  30.74 
 
 
847 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3670  hypothetical protein  32.61 
 
 
851 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.758768  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4413  hypothetical protein  41.87 
 
 
376 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4416  hypothetical protein  34.42 
 
 
472 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.710672  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3322  S8A family peptidase  24.75 
 
 
795 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.546962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0448  hypothetical protein  26.62 
 
 
712 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3504  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.23 
 
 
827 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.227841  normal  0.192563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2639  hypothetical protein  24.42 
 
 
821 aa  78.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0443804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5592  hypothetical protein  23.43 
 
 
293 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1641  Subtilisin-like serine protease protein  23.53 
 
 
570 aa  59.3  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2521  hypothetical protein  21.68 
 
 
869 aa  58.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.828375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0523  hypothetical protein  21.62 
 
 
743 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4146  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.98 
 
 
729 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0370543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.47 
 
 
1172 aa  47  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3795  hypothetical protein  24.14 
 
 
740 aa  45.8  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.542831  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  26.6 
 
 
551 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>