26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4584 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4585  conjugative transfer protein  99.54 
 
 		 436 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.774024 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4584  conjugative transfer protein  100 
 
 		 436 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4434  conjugative transfer protein  99.31 
 
 		 436 aa  878    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.413402  hitchhiker  0.00000046474 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4499  conjugative transfer protein  99.31 
 
 		 436 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0252  conjugative transfer protein  77.98 
 
 		 436 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4636  conjugative transfer protein  99.54 
 
 		 436 aa  879    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.403008  normal  0.321234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3221  putative plasmid transfer protein  40.38 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0705  putative plasmid transfer protein  41.38 
 
 		 399 aa  307  3e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0106  TraF  37.39 
 
 		 400 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0051  putative plasmid transfer protein  38.18 
 
 		 396 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000649628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0557  putative plasmid transfer protein  36.26 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0619  putative plasmid transfer protein  35.13 
 
 		 397 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3174  putative outer membrane or exported  32.41 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4649  hypothetical protein  38.68 
 
 		 266 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0529  putative plasmid transfer protein  29.73 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000622443  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0517  putative plasmid transfer protein  33.41 
 
 		 398 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.359059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2920  hypothetical protein  31.03 
 
 		 380 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.448898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000817  hypothetical protein  31.71 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529615  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000131  TraF-related protein  29.91 
 
 		 373 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00236694  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0502  hypothetical protein  30.73 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00214405  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0674  hypothetical protein  28.31 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05738  hypothetical protein  29 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4044  putative plasmid transfer protein  33.02 
 
 		 357 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4490  hypothetical protein  27.45 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3650  ribonuclease PH  25 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0790  hypothetical protein  27.88 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>