253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2944 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2944  IS3, transposase orfA  100 
 
 
99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  6.3441799999999996e-27 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0357  IS3 transposase OrfA  94.95 
 
 
99 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.562074  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1238  IS3 OrfA  93.94 
 
 
99 aa  185  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431772  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1117  IS3 OrfA  92.93 
 
 
99 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01029  putative transposase-related protein  85.86 
 
 
102 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01359  putative transposase-related protein  85.86 
 
 
102 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01524  putative transposase-related protein  85.86 
 
 
102 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02695  putative transposase-related protein  85.86 
 
 
102 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1570  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.256983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2507  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.419774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2615  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0374663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3236  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3305  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.130076  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1146  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0273368  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0083  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.013235  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0078  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.598745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1772  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01036  hypothetical protein  85.86 
 
 
102 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1147  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4846  IS3, transposase orfA  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2569  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3745  transposase IS3/IS911 family protein  85.86 
 
 
99 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0203126  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3024  IS3, transposase orfA  84.85 
 
 
99 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.433294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0728  transposase IS3/IS911 family protein  84.85 
 
 
99 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.999071  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3717  transposase IS3/IS911 family protein  84.85 
 
 
99 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615031  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1227  transposase IS3/IS911 family protein  81.82 
 
 
99 aa  157  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4201  transposase IS3/IS911 family protein  77.78 
 
 
98 aa  147  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3156  ISEc16 transposase orfA  80.81 
 
 
99 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1963  transposase IS3/IS911 family protein  65.93 
 
 
94 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1466  transposase IS3/IS911 family protein  65.93 
 
 
94 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3923  transposase IS3/IS911 family protein  65.93 
 
 
94 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0174  transposase IS3/IS911 family protein  65.93 
 
 
94 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20550  Transposase IS3/IS911  56.04 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16540  Transposase IS3/IS911  56.04 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1291  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0615  transposase IS3/IS911 family protein  51.09 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.511326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0766  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
97 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06246  hypothetical protein  60 
 
 
70 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1287  transposase IS3/IS911 family protein  48.35 
 
 
97 aa  85.9  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.439238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09770  Transposase IS3/IS911  54.43 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40540  Transposase IS3/IS911  54.43 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41880  Transposase IS3/IS911  54.43 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4159  putative transposase  76.09 
 
 
56 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.137992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1458  hypothetical protein  77.78 
 
 
49 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0651  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0462736  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1128  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1988  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.275987  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1992  transposase IS3/IS911 family protein  34.44 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.203185  normal  0.714899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0140  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1583  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1704  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2162  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.102712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1374  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2643  transposase IS3/IS911 family protein  33.33 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0189783  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198.1  putative transposase  62.79 
 
 
43 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0106  transposase IS3/IS911  38 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3811  transposase IS3/IS911  38 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000498909 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02982  transposase IS3  35.96 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2893  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3713  transposase IS3/IS911 family protein  35.56 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0736019 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3328  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2169  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263727  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4526  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4682  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4708  transposase IS3/IS911 family protein  37.89 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4363  transposase IS3/IS911 family protein  38.95 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2066  transposase IS3/IS911 family protein  39.56 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0227853  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  36.26 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2446  putative transposase, ISRSO8 orfA like  38.24 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00154795  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3770  putative transposase  38.24 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1058  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.469795 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0572  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227218  normal  0.0257907 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5317  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0586  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275547  hitchhiker  0.00017462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2547  putative IS1 transposase, InsA  36.56 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518998  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0550  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0833595  normal  0.0964191 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0186  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.186079 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0071  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694187 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5972  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263153  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6073  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0030  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1613  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3349  transposase IS3/IS911  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3770  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3943  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.352485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4658  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5453  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5680  transposase DNA binding site ISRme3  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6259  transposase IS3/IS911 family protein  37.36 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.523501  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3927  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.180463 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3814  transposase IS3/IS911 family protein  37.25 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.339406 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0005  ISMca2 transposase OrfA  37 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0472147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  37.5 
 
 
91 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1847  putative transposase  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2086  putative transposase  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359957  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2543  putative transposase  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379172  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2734  putative IS3 transposase OrfA  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0333986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3566  putative transposase  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0132  transposase  38.04 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>