17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2871 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2871  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2568  hypothetical protein  48.36 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527973 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1756  hypothetical protein  31.78 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1287  hypothetical protein  30.35 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2859  hypothetical protein  31.23 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0612  hypothetical protein  33.19 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5311  hypothetical protein  28.79 
 
 		 287 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0698  hypothetical protein  26.14 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0782955  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1214  hypothetical protein  26.95 
 
 		 294 aa  89  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4915  hypothetical protein  30.53 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00458522  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10358  hypothetical protein  25.82 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.834862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0452  hypothetical protein  27.39 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000310711  decreased coverage  0.00000000190232 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06481  hypothetical protein  28.22 
 
 		 230 aa  52.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1304  hypothetical protein  24.15 
 
 		 252 aa  52.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3163  hypothetical protein  23.35 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1305  hypothetical protein  23.39 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2550  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>