37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0548 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0548    100 
 
 		 446 bp  884    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2541    82.88 
 
 		 387 bp  151  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.494511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0135  hypothetical protein  81.82 
 
 		 978 bp  137  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3680  hypothetical protein  82.1 
 
 		 978 bp  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1921  hypothetical protein  82.1 
 
 		 978 bp  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    82.1 
 
 		 1107 bp  135  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2392  hypothetical protein  85.14 
 
 		 978 bp  133  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.134929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2393  hypothetical protein  85.14 
 
 		 717 bp  133  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0597783  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    82.13 
 
 		 902 bp  123  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0200  hypothetical protein  81.51 
 
 		 882 bp  117  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1609  hypothetical protein  86.41 
 
 		 150 bp  85.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2402  hypothetical protein  86.84 
 
 		 978 bp  71.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.283143  normal  0.277541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0957  hypothetical protein  87.32 
 
 		 978 bp  69.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00250015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1861  hypothetical protein  81.21 
 
 		 991 bp  65.9  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2622  hypothetical protein  85.71 
 
 		 960 bp  65.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0144606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2555  hypothetical protein  85.71 
 
 		 978 bp  65.9  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2256  hypothetical protein  85.06 
 
 		 114 bp  61.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1890  hypothetical protein  87.3 
 
 		 978 bp  61.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1510  hypothetical protein  84.81 
 
 		 978 bp  61.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2838  hypothetical protein  92.68 
 
 		 561 bp  58  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.579373  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1511  hypothetical protein  86.15 
 
 		 978 bp  58  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1812  hypothetical protein  89.8 
 
 		 951 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3473  hypothetical protein  86.15 
 
 		 978 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0670  hypothetical protein  89.8 
 
 		 978 bp  58  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1859    87.5 
 
 		 930 bp  56  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.434219  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4530  hypothetical protein  82.24 
 
 		 978 bp  54  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1264  hypothetical protein  84.51 
 
 		 978 bp  54  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0945    86.44 
 
 		 479 bp  54  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.836757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0979  hypothetical protein  88 
 
 		 243 bp  52  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0499  hypothetical protein  82.22 
 
 		 561 bp  52  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3447  hypothetical protein  89.13 
 
 		 978 bp  52  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3040  hypothetical protein  89.13 
 
 		 978 bp  52  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1547  hypothetical protein  84.62 
 
 		 978 bp  50.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1377    85 
 
 		 1010 bp  48.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1858    82.89 
 
 		 210 bp  48.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0116  hypothetical protein  84.13 
 
 		 978 bp  46.1  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1553    84.75 
 
 		 968 bp  46.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>