17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2041 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2041  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 2336 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1800  protein of unknown function DUF1555  27.19 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3874  hypothetical protein  35.04 
 
 		 787 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3136  hypothetical protein  35.2 
 
 		 787 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4980  hypothetical protein  35.29 
 
 		 685 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4983  hypothetical protein  35.29 
 
 		 549 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.37 
 
 		 1236 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  29.06 
 
 		 1712 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0666  peptidase S41  59.38 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.438312  hitchhiker  0.000531338 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0538  hypothetical protein  27.07 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.562181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1502  hypothetical protein  32.27 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0590  protein of unknown function DUF1555  25.45 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.579939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  30.56 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  26.49 
 
 		 833 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4100  hypothetical protein  31.91 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00402166  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1134  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0722536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>