18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1965 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1965  hypothetical protein  100 
 
 		 423 aa  885    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35800  hypothetical protein  37.44 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149745  decreased coverage  5.600339999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3060  hypothetical protein  37.44 
 
 		 438 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3721  hypothetical protein  36.13 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.631382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0050  hypothetical protein  36.59 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2515  hypothetical protein  33.17 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17861  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1072  hypothetical protein  31.59 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0463115  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4972  hypothetical protein  32.5 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.990538  normal  0.205743 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4729  hypothetical protein  30.84 
 
 		 423 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.597904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2297  hypothetical protein  28.53 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.500408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2194  hypothetical protein  25.41 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4707  hypothetical protein  26.11 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2716  hypothetical protein  25.91 
 
 		 415 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.382449  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3370  hypothetical protein  25.36 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.660681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0710  hypothetical protein  23.94 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000886213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4083  hypothetical protein  23.86 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1494  hypothetical protein  22.44 
 
 		 370 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.967694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09610  hypothetical protein  24.29 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>