26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1193 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  628  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  48.54 
 
 		 290 aa  285  5e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  49 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  42.86 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 308 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  40.89 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  42.62 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  41.88 
 
 		 281 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  37.29 
 
 		 151 aa  85.9  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2407  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 404 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17617  normal  0.530152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 123 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 		 736 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 716 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.33 
 
 		 634 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.78 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 762 aa  42.7  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 597 aa  42.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2790  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 119 aa  42.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>