26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1121 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1121  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1095    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.258088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4673  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  29.66 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2698  glycoside hydrolase family 5  26.94 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6857  glycoside hydrolase family 5  34.72 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07639  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  29.91 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.307067 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1542  carbohydrate binding module 27  24.61 
 
 		 667 aa  73.9  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000596448  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6731  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  32.04 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1591  carbohydrate binding module 27  24.62 
 
 		 669 aa  73.2  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00319954  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  31.72 
 
 		 1050 aa  72.8  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2802  glycoside hydrolase family 5  27.55 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461879  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  28.68 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42201  predicted protein  26.01 
 
 		 321 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09276  beta-1,4-endomannanase (Eurofung)  28.9 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_3863  predicted protein  24.24 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4201  putative glycosyl hydrolase  27.95 
 
 		 378 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1040  mannanase, putative  27.91 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03297  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT9]  28.06 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0788687 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03358  Endo-beta-1,4-mannanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT7]  27.39 
 
 		 383 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.725351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4958  endo-beta-mannanase-like protein  23.04 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.777337  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4036  predicted protein  25.84 
 
 		 263 aa  50.8  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06427  Endo-beta-1,4-mannanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZ53]  23.45 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  32.26 
 
 		 394 aa  48.9  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.73 
 
 		 834 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1418  hypothetical protein  30.97 
 
 		 408 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0436845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.2 
 
 		 1735 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0509  mannanase, putative  23.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0374435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>