23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1022 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 110 aa  231  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  40 
 
 		 114 aa  93.6  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  34.86 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  38.18 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.62 
 
 		 116 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  35.45 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  35.45 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  36.7 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  34.55 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  34.55 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  34.55 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.82 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  35.45 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  35.58 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  31.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  31.82 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  30.28 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  28.44 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  24.74 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  24.74 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  28.05 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  27.06 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  26.61 
 
 		 109 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>