23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0020 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 116 aa  242  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  41.9 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.62 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  37.96 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  35.85 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  35.85 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  36.79 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  33.02 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  33.02 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.29 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  38 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  36 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  36.27 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  32.08 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  32.11 
 
 		 166 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  32.41 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  34.23 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.43 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  35.16 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  36.92 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4848  hypothetical protein  31.25 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.988935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  24.24 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  34.44 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>