20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3346 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.86 
 
 		 110 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.94 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  37.27 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  37.27 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.14 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  36.36 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  33.64 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  28.18 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  30.91 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  31.73 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  29.09 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  27.62 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  28.16 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.24 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5975  hypothetical protein  25.74 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.903409  normal  0.674461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  25.69 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  27.27 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>