21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3882 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  217  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  51.82 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  50.91 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  52.73 
 
 		 110 aa  103  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.7 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  37.27 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  36.04 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  34.23 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  29.09 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.23 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  33.33 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  31.53 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.46 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  30.91 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  26.17 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  28 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  30.23 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>