21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0620 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  100 
 
 		 110 aa  220  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  41.82 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  37.14 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.73 
 
 		 114 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  37.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  37.84 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  36.94 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  36.94 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  37.39 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  37.84 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  35.14 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  34.23 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.43 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  32.46 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  38.82 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  36.21 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  25.71 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  39.22 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  39.22 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  34.38 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5975  hypothetical protein  28.89 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.903409  normal  0.674461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>