23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3692 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  63.41 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  63.41 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  48.15 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.85 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  31.13 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  33.66 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.26 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  31.48 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  28.04 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  28.97 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  27.62 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  27.1 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  32.29 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  27.52 
 
 		 119 aa  47.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  26.17 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  25.71 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.5 
 
 		 110 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0037  hypothetical protein  32 
 
 		 127 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5975  hypothetical protein  24.24 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.903409  normal  0.674461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  30.21 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>