23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1003 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  64.22 
 
 
109 aa  143  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  58.72 
 
 
109 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4361  hypothetical protein  56.88 
 
 
109 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.014453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  35.45 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  34.55 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  32.73 
 
 
110 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  30.28 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.86 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  33.64 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  33.64 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  30 
 
 
112 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  31.53 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.92 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  28.16 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5975  hypothetical protein  31.19 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.903409  normal  0.674461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  30.91 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  30.63 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.52 
 
 
110 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1143  hypothetical protein  24.18 
 
 
128 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000327327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>