22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2776 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  99.09 
 
 		 110 aa  219  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  97.27 
 
 		 110 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  70 
 
 		 110 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4828  hypothetical protein  64.81 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187426  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2375  hypothetical protein  63.64 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  hitchhiker  0.000290805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3751  hypothetical protein  53.15 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3882  hypothetical protein  51.82 
 
 		 109 aa  115  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  42.99 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  36.19 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  34.55 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3346  hypothetical protein  36.36 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0359  hypothetical protein  36.94 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  32.08 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  36.94 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  33.64 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0026  hypothetical protein  31.82 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  28.04 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4632  hypothetical protein  30.43 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496365  normal  0.0973138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  26.85 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4848  hypothetical protein  30.12 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.988935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  27.18 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>