14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2006 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2006  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  273  4e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664625  normal  0.308541 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1810  hypothetical protein  99.25 
 
 		 134 aa  273  9e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2601  hypothetical protein  65.04 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00112526  normal  0.44225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3692  hypothetical protein  63.41 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  0.0832405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0020  RNA methyltransferase TrmH, group 3  35.85 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0947613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0534  hypothetical protein  30.1 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5135  RNA methyltransferase TrmH, group 3  33.93 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1022  RNA methyltransferase TrmH, group 3  24.74 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3065  hypothetical protein  28.28 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1003  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0620  RNA methyltransferase TrmH, group 3  39.22 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.1329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2803  hypothetical protein  28.04 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2776  hypothetical protein  27.18 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.238427  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2820  hypothetical protein  27.18 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.804057  normal  0.0153467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>