44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3653 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3653  transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.409424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3459  transcriptional regulator, CadC  98.39 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0833  transcriptional regulator, CadC  98.39 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3534  transcriptional regulator, CadC  96.79 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3240  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  66.8 
 
 		 247 aa  349  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0783  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  66.8 
 
 		 247 aa  348  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3343  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  66.8 
 
 		 247 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0940  transcriptional regulator-related protein  64.37 
 
 		 247 aa  340  9e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0880  transcriptional regulator, CadC  65.59 
 
 		 247 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102623  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3438  winged helix family two component response transcriptional regulator  46.99 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3632  response regulator receiver protein  46.99 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2749  putative transcriptional regulator, CadC  47.01 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0883  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0760  response regulator receiver protein  42.49 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0885  transcriptional regulator, CadC  46.4 
 
 		 246 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0653  hypothetical protein  26.98 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0879  hypothetical protein  27.41 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0881  putative transcriptional regulator, CadC  24.8 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0936  transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3347  transcriptional regulator  24.11 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.730311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3244  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0793  putative transcriptional regulator, CadC  23.08 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.790637  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0779  response regulator receiver protein  22.4 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0757  putative transcriptional regulator, CadC  38.14 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.19634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3465  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  31.14 
 
 		 435 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.817886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4023  invasion protein regulator  33.33 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.876946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  33.67 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  34.09 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  33.71 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 493 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  36.11 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  37.84 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  37.84 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  36.11 
 
 		 230 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  32.91 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1255  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.85 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0089  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 171 aa  42.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  40 
 
 		 224 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 253 aa  42  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>