77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1103 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  99.92 
 
 		 1197 bp  2365    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  99.92 
 
 		 1197 bp  2365    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  100 
 
 		 1197 bp  2373    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  100 
 
 		 1197 bp  2373    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  100 
 
 		 1197 bp  2373    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  100 
 
 		 1197 bp  2373    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1103    100 
 
 		 2017 bp  3998    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  99.83 
 
 		 1197 bp  2357    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  97.42 
 
 		 567 bp  620  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  96.26 
 
 		 567 bp  587  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  95.91 
 
 		 567 bp  567  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  95.91 
 
 		 567 bp  567  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  95.91 
 
 		 567 bp  567  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  95.91 
 
 		 567 bp  567  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  95.91 
 
 		 567 bp  567  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1105  isochorismatase  100 
 
 		 255 bp  505  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  92.24 
 
 		 567 bp  476  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  80.17 
 
 		 1263 bp  145  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.89 
 
 		 1206 bp  137  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.89 
 
 		 1206 bp  137  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  80.17 
 
 		 1263 bp  133  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2204    79.6 
 
 		 801 bp  129  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  79.6 
 
 		 1281 bp  129  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0890    79.6 
 
 		 801 bp  129  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0480    79.6 
 
 		 1224 bp  129  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1751    79.6 
 
 		 801 bp  129  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183737  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  79.6 
 
 		 801 bp  129  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0576    79.32 
 
 		 1293 bp  121  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0983085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  79.93 
 
 		 1263 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2705  putative IS110 transposase  83.63 
 
 		 771 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  83.63 
 
 		 1263 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  79.93 
 
 		 1263 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  83.63 
 
 		 1263 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  83.63 
 
 		 1263 bp  117  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  80.16 
 
 		 1263 bp  105  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  80.16 
 
 		 1263 bp  105  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  80.16 
 
 		 1263 bp  105  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  80.16 
 
 		 1263 bp  105  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  80.16 
 
 		 1263 bp  105  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.02 
 
 		 336 bp  99.6  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5264  transposase IS116/IS110/IS902  81.46 
 
 		 336 bp  91.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  89.61 
 
 		 738 bp  89.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    89.61 
 
 		 467 bp  89.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2708    89.61 
 
 		 579 bp  89.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  81.11 
 
 		 567 bp  87.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  100 
 
 		 570 bp  81.8  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0143  transposase  100 
 
 		 438 bp  79.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.931435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  80.56 
 
 		 567 bp  79.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  80.56 
 
 		 567 bp  79.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  80.56 
 
 		 567 bp  79.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7787    82.58 
 
 		 1261 bp  79.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1388  hypothetical protein  87.84 
 
 		 150 bp  75.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.708201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  80 
 
 		 567 bp  71.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  87.32 
 
 		 567 bp  69.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 705 bp  58  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0100  hypothetical protein  79.68 
 
 		 390 bp  54  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0202792  hitchhiker  0.0000236934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2866  hypothetical protein  96.67 
 
 		 192 bp  52  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.501435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>