41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2009 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271087  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  31.4 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 317 aa  48.9  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  30.65 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3960  methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 535 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00884367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  30.95 
 
 		 198 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 2490 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  30.33 
 
 		 305 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.4 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  23.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.97 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 535 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.34 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  26.53 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0399  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  23.33 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  26.85 
 
 		 535 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  24.06 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23400  16S RNA G1207 methylase RsmC  30.66 
 
 		 411 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.498455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0895  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0858242  normal  0.196443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 		 264 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  27.83 
 
 		 280 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 219 aa  42.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  27.49 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 204 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  24.6 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.97 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.3 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  28.15 
 
 		 247 aa  42  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.133585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 204 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.67 
 
 		 256 aa  42  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 226 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>