16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1518 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1518  hypothetical protein  100 
 
 
520 aa  1054    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7199  hypothetical protein  25.64 
 
 
423 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0783166  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6294  hypothetical protein  26.84 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5998  hypothetical protein  27.3 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5496  hypothetical protein  25.09 
 
 
423 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.117089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6782  hypothetical protein  25.09 
 
 
423 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.0675902 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6370  hypothetical protein  25.09 
 
 
423 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.632795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2575  hypothetical protein  23.56 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2370  hypothetical protein  24.84 
 
 
461 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217776  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1524  hypothetical protein  37.31 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0583  hypothetical protein  40.91 
 
 
414 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.525477 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4401  hypothetical protein  24.76 
 
 
534 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1163  hypothetical protein  41.18 
 
 
323 aa  47  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724122  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2270  hypothetical protein  35.44 
 
 
418 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.763096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2655  hypothetical protein  31.97 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3961  hypothetical protein  29.71 
 
 
381 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.341792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>