20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5026 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_5026  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4516  hypothetical protein  86.45 
 
 
310 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6465  hypothetical protein  57.29 
 
 
295 aa  288  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00930  hypothetical protein  52.84 
 
 
292 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0240  SEC-C motif domain protein  51.85 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148916 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3246  hypothetical protein  49.28 
 
 
278 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.109368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0215  SEC-C motif domain protein  46.2 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01600  hypothetical protein  44.6 
 
 
308 aa  219  7e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763888  normal  0.512489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3190  hypothetical protein  48.53 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.705684  normal  0.0225528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0237  SEC-C motif domain protein  52 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0374  hypothetical protein  47.97 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.276322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0079  SEC-C motif domain protein  45.37 
 
 
314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0162  SecC motif-containing protein  44.92 
 
 
312 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01620  hypothetical protein  45.96 
 
 
275 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06710  hypothetical protein  43.75 
 
 
276 aa  205  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0259  hypothetical protein  41.54 
 
 
274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.11546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0161  SecC motif-containing protein  44.62 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal  0.0707299 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4413  hypothetical protein  40.23 
 
 
390 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0311591  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0134  hypothetical protein  40.58 
 
 
298 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0170  hypothetical protein  38.49 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>