14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0936 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  100 
 
 		 3677 aa  7268    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  32.72 
 
 		 3437 aa  613  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  30.45 
 
 		 966 aa  126  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  31.49 
 
 		 9529 aa  98.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  24.06 
 
 		 3754 aa  91.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1939 aa  81.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  30 
 
 		 5128 aa  80.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  27.05 
 
 		 2247 aa  80.5  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  27.07 
 
 		 5185 aa  76.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1275 aa  66.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 		 7422 aa  65.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1737  hypothetical protein  30.65 
 
 		 919 aa  61.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6461  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1368 aa  56.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05950  hypothetical protein  34.71 
 
 		 670 aa  50.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.846681  normal  0.745522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>