11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1737 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1737  hypothetical protein  100 
 
 		 919 aa  1837    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  34.57 
 
 		 966 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9191  hypothetical protein  29.51 
 
 		 2213 aa  115  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  31.19 
 
 		 3677 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  32.02 
 
 		 3437 aa  75.1  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  22.04 
 
 		 2247 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1939 aa  48.9  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  20.28 
 
 		 5128 aa  48.5  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1275 aa  48.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4829  hypothetical protein  22.71 
 
 		 5185 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.13 
 
 		 7422 aa  46.2  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>