27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1217 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 7422 aa  14770    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  83.55 
 
 		 1275 aa  1286    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2526  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1952 aa  450  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.258664  hitchhiker  0.00801542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1214  hypothetical protein  35.16 
 
 		 2922 aa  298  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.756047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  49.61 
 
 		 2247 aa  262  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1213  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1847 aa  161  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.561401 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1714  hypothetical protein  23.28 
 
 		 891 aa  114  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.804907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  33.05 
 
 		 966 aa  90.9  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  30.06 
 
 		 2906 aa  68.2  0.000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  27.49 
 
 		 3677 aa  64.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.86 
 
 		 540 aa  62.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.9 
 
 		 862 aa  60.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0296338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0596  lipoprotein (VmcA)  22.91 
 
 		 492 aa  58.9  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.605636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2819  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.52 
 
 		 1474 aa  57.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  21.73 
 
 		 2277 aa  57.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  18.13 
 
 		 566 aa  57  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  17.39 
 
 		 1285 aa  56.2  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.295891 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  25.45 
 
 		 762 aa  54.3  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  19.91 
 
 		 1475 aa  53.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.15 
 
 		 550 aa  53.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.23 
 
 		 547 aa  53.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3437 aa  53.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  20.9 
 
 		 549 aa  52  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.05 
 
 		 519 aa  51.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0416  multiple banded antigen  23.32 
 
 		 355 aa  50.8  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2612  hypothetical protein  26.67 
 
 		 295 aa  50.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27044  predicted protein  25.6 
 
 		 743 aa  48.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342016  hitchhiker  0.00159724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>