27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1435 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 3437 aa  6667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  32.65 
 
 		 3677 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7413  hypothetical protein  29.27 
 
 		 966 aa  110  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38108  normal  0.924213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6458  hypothetical protein  41.91 
 
 		 9529 aa  105  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.84 
 
 		 830 aa  92.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  26.2 
 
 		 2313 aa  92.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  35.91 
 
 		 671 aa  90.1  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  29.23 
 
 		 3754 aa  90.1  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15555  predicted protein  36.15 
 
 		 1706 aa  71.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1737  hypothetical protein  32.02 
 
 		 919 aa  68.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2525  hypothetical protein  24.27 
 
 		 2247 aa  65.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00422274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  30.92 
 
 		 916 aa  63.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1215  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1275 aa  62.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0816157  normal  0.554588 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48647  predicted protein  44.33 
 
 		 636 aa  62.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.453623  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  47.71 
 
 		 840 aa  61.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1217  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 7422 aa  60.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.446236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  26.24 
 
 		 1394 aa  57.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  28.61 
 
 		 2353 aa  54.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  34.29 
 
 		 962 aa  53.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  30.73 
 
 		 1186 aa  52  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  32.71 
 
 		 1068 aa  52  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  32.57 
 
 		 423 aa  51.2  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  31.45 
 
 		 1012 aa  50.4  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  32.92 
 
 		 1142 aa  47.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  32.2 
 
 		 848 aa  47  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  35.25 
 
 		 453 aa  47.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2281  serine threonine rich antigen  40.84 
 
 		 1870 aa  47  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>