20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8487 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8487  hypothetical protein  100 
 
 
5128 aa  10370    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1440  hypothetical protein  38.81 
 
 
299 aa  87  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386026  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0936  hypothetical protein  30 
 
 
3677 aa  80.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23510  hypothetical protein  37.59 
 
 
1465 aa  79.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  unclonable  0.00000499426  normal  0.846477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1435  hypothetical protein  27.92 
 
 
3437 aa  65.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0503508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2580  hypothetical protein  33.87 
 
 
1291 aa  63.9  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0761395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  34.92 
 
 
502 aa  63.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  38.82 
 
 
1301 aa  55.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  32.29 
 
 
3036 aa  52  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0738  hypothetical protein  27.94 
 
 
164 aa  51.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  36.84 
 
 
1409 aa  51.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1935  hypothetical protein  26.05 
 
 
503 aa  50.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1943  hypothetical protein  29.79 
 
 
503 aa  50.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  32.1 
 
 
1509 aa  50.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  35.53 
 
 
1388 aa  49.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  36.84 
 
 
312 aa  48.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8529  hypothetical protein  26.94 
 
 
1939 aa  48.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667602  normal  0.0232783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  36.84 
 
 
314 aa  48.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  36.84 
 
 
314 aa  48.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  36.84 
 
 
314 aa  48.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>