30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0159 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0159  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  352  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2703  hypothetical protein  58.38 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3387  hypothetical protein  59.41 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1183  hypothetical protein  52.33 
 
 		 180 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.332216  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1172  hypothetical protein  45.28 
 
 		 174 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2627  hypothetical protein  38.79 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1971  hypothetical protein  36.75 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0326  hypothetical protein  37.35 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.663922  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2768  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2948  hypothetical protein  35.8 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2974  hypothetical protein  36.65 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.328088 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3484  hypothetical protein  34.97 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.280863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2321  hypothetical protein  30.88 
 
 		 234 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1129  hypothetical protein  33.74 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1821  hypothetical protein  35.85 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.912712  normal  0.374512 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1761  hypothetical protein  37.35 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0310951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3162  regulatory protein, LuxR  33.72 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0113  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 429 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  36.25 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 309 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0055  hypothetical protein  32.35 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  36.25 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  36.9 
 
 		 89 aa  44.3  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  42.47 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  40.82 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 216 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  42 
 
 		 196 aa  40.8  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>