15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0142 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.913303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5332  MobA/MobL protein  27.21 
 
 		 498 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.873373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3950  conjugal transfer relaxase TraA  29.36 
 
 		 1039 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.630291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4520  conjugal transfer relaxase TraA  29.36 
 
 		 998 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3630  MobA/MobL protein  30.63 
 
 		 361 aa  46.2  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  28.08 
 
 		 968 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0467  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  35.37 
 
 		 1536 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0100  conjugal transfer relaxase TraA  28.44 
 
 		 998 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5162  MobA/MobL protein  30.95 
 
 		 498 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0002  MobA/MobL family protein  30.34 
 
 		 719 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29222  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1788  MobA/MobL protein  23.31 
 
 		 544 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.96066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  26.67 
 
 		 1034 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2276  conjugal transfer relaxase TraA  25.69 
 
 		 1006 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.179337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0994  conjugal transfer relaxase TraA  25.69 
 
 		 1034 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112891  decreased coverage  0.0000169955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2314  MobA/MobL family protein  24.16 
 
 		 506 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127773  hitchhiker  0.00000000000117095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>