38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0599 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  100 
 
 		 314 aa  650    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  69.75 
 
 		 314 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  38.98 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  39.67 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  39.26 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  39.26 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  38.41 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  35.79 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  33.97 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  38.16 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  33.1 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  35.74 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  31.74 
 
 		 503 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  32.88 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.06 
 
 		 503 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  32.26 
 
 		 395 aa  139  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  29.75 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  28.39 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  30.57 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  32.05 
 
 		 404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  32.34 
 
 		 387 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  30.27 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  32.57 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  32.57 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  28.62 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  35 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  24.91 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  26.98 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  24.7 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  26.35 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  24.5 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  26.49 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  24.61 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  26.06 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  25.5 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0936  GHMP kinase domain-containing protein  23.37 
 
 		 402 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579277  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0056  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol kinase  32.29 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0440  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  29.03 
 
 		 266 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>