More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1919 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  100 
 
 
311 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  79.35 
 
 
311 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  79.35 
 
 
311 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  39.68 
 
 
322 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  37.9 
 
 
325 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  38.29 
 
 
319 aa  195  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  36.59 
 
 
325 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  37.97 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  36.59 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  36.48 
 
 
325 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  35.96 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  40.57 
 
 
333 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  35.49 
 
 
311 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  36.65 
 
 
334 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.07 
 
 
326 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  36.2 
 
 
358 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  33.23 
 
 
348 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  34.44 
 
 
344 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  33.73 
 
 
363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  32.9 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  34.17 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  34.76 
 
 
345 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  31.97 
 
 
322 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  32.8 
 
 
329 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  29.35 
 
 
312 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  33.33 
 
 
311 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  34.05 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  35.67 
 
 
336 aa  155  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  32.94 
 
 
348 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  35.37 
 
 
329 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  35.51 
 
 
336 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  33.11 
 
 
320 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  32.7 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  33.13 
 
 
316 aa  146  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  32.27 
 
 
323 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  32.28 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.22 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.76 
 
 
316 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  29.43 
 
 
328 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  29.45 
 
 
304 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.92 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.96 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.57 
 
 
328 aa  85.5  9e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  25.36 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  25.39 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  24.32 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  27.24 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  24.29 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  25.36 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  24.29 
 
 
345 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  24.29 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  25 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  25 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  25.6 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  25.45 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  27.73 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  25.36 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  25.35 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  25.35 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  25.36 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  25.56 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  25.17 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  27.21 
 
 
287 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  25.17 
 
 
323 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  26.86 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  26.74 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  25.9 
 
 
330 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  23.84 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  25.17 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  25.94 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  26.97 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  27.7 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  24.91 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  23.76 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  26.4 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.64 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  24.49 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  25.28 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  25.59 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  24.72 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  27.05 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  25.84 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  25.67 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  24.66 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  25.74 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  25.99 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  26.2 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  25.99 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  25.74 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0509  putative agmatinase  25 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  25.74 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  25.99 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  25.74 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3024  putative agmatinase  23.49 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197883  normal  0.651701 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  25.74 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>