36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1325 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1325  diphosphomevalonate decarboxylase  100 
 
 		 314 aa  656    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0599  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  69.75 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1123  diphosphomevalonate decarboxylase  41.84 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0239  mevalonate diphosphate decarboxylase  40.33 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0629  mevalonate diphosphate decarboxylase  40.54 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0614  mevalonate diphosphate decarboxylase  40.54 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1734  diphosphomevalonate decarboxylase  37.59 
 
 		 332 aa  185  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1101  diphosphomevalonate decarboxylase  37.13 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.183579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0914  diphosphomevalonate decarboxylase  36.86 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000162632  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1034  mevalonate pyrophosphate decarboxylase  35.46 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1386  diphosphomevalonate decarboxylase  36.24 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0313  diphosphomevalonate decarboxylase  37.59 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0381784 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0619  diphosphomevalonate decarboxylase  34.47 
 
 		 503 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0720  diphosphomevalonate decarboxylase/isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  33.79 
 
 		 503 aa  152  7e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0013091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0455  diphosphomevalonate decarboxylase  33.68 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0783  diphosphomevalonate decarboxylase  29.57 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.424746  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04950  diphosphomevalonate decarboxylase, putative  28.39 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0706  diphosphomevalonate decarboxylase  29.22 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1576  diphosphomevalonate decarboxylase  31.21 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00467699 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2018  hypothetical protein  32.47 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2023  hypothetical protein  32.47 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90752  predicted protein  29.53 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1612  diphosphomevalonate decarboxylase  29.57 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04414  diphosphomevalonate decarboxylase (AFU_orthologue; AFUA_4G07130)  28.66 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00225214  normal  0.629565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3408  diphosphomevalonate decarboxylase  33.1 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0207925  normal  0.138111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04605  hypothetical protein  26.23 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0691  diphosphomevalonate decarboxylase  24.18 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0953397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1389  GHMP kinase  25.37 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0497  GHMP kinase  25.71 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000421791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1087  diphosphomevalonate decarboxylase  24.82 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3390  GHMP kinase domain-containing protein  24.92 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.199824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2128  diphosphomevalonate decarboxylase  22.7 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.706663  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1434  GHMP kinase  24.5 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3235  GHMP kinase  23.76 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1538  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  32.31 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00561271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2005  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.57 
 
 		 280 aa  42.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000192369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>