23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1741 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  476  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  58.02 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  25.67 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  37.34 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  28.07 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  25.45 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1437  putative integral membrane protein  33.88 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.620997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  29.2 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  31.37 
 
 
244 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  26.94 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  27.16 
 
 
259 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2806  hypothetical protein  29.02 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.60681  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  27.37 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  36 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4793  hypothetical protein  49.09 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0992  hypothetical protein  30.56 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0984  conserved hypothetical protein, membrane  23.66 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.877759  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  30.84 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44461  predicted protein  34.67 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.844276  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  30.32 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  23.53 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05100  hypothetical protein  40.85 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5830  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.649259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>