17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4793 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4793  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0207  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4209  hypothetical protein  27.5 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  30.21 
 
 
269 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  21.24 
 
 
263 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0261  hypothetical protein  28.82 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  25.15 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26400  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.597608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09970  hypothetical protein  31.68 
 
 
267 aa  49.3  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.887805  normal  0.308407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  27.72 
 
 
262 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3295  putative integral membrane protein  38.1 
 
 
330 aa  45.8  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.179488  decreased coverage  0.00096704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5493  hypothetical protein  24.38 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0264977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  24 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4551  hypothetical protein  36.71 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1694  hypothetical protein  36.84 
 
 
244 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  21.59 
 
 
269 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>