12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44461 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44461  predicted protein  100 
 
 
357 aa  727    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.844276  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44296  predicted protein  27.34 
 
 
289 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4215  hypothetical protein  24.73 
 
 
263 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4628  hypothetical protein  31.01 
 
 
259 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1741  hypothetical protein  30.07 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196782  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0915  hypothetical protein  23.38 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.187168  hitchhiker  1.25009e-16 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46392  predicted protein  24 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5202  hypothetical protein  21.24 
 
 
269 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28697  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3311  hypothetical protein  28.34 
 
 
256 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02585  hypothetical protein  22.09 
 
 
269 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2533  hypothetical protein  25.76 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42787  predicted protein  26.99 
 
 
309 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0920905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>