12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3222 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  69.78 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  46.93 
 
 		 548 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  46.93 
 
 		 577 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  40.64 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  32.37 
 
 		 261 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  29.75 
 
 		 284 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  26.92 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  27 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  29.56 
 
 		 274 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  30.3 
 
 		 289 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  34.83 
 
 		 269 aa  41.6  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>