39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3005 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  93.95 
 
 		 355 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  722    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  46.41 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  45.92 
 
 		 356 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  45.92 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  45.92 
 
 		 356 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  46.15 
 
 		 353 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  45.17 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  44.26 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  44.11 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  45.3 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  44.54 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  44.35 
 
 		 426 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  41.85 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  46.26 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  45.11 
 
 		 357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  42.33 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  43.33 
 
 		 361 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  45.33 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  43.11 
 
 		 365 aa  290  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  40.11 
 
 		 370 aa  291  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  42.27 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  40.67 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  42.03 
 
 		 357 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  43.54 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  39.11 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  35.86 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  31.28 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  33.24 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  41.38 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  27.3 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  32.31 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  33.9 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  26.46 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  34.27 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  31.72 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0986  hypothetical protein  25.24 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.432153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2571  protein of unknown function DUF450  27.68 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>