37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0616 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3776    86.03 
 
 		 823 bp  656    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0616    100 
 
 		 860 bp  1705    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0752    99.53 
 
 		 860 bp  1673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.874544  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3739    99.3 
 
 		 860 bp  1657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3534    99.53 
 
 		 860 bp  1673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3184    99.77 
 
 		 860 bp  1689    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2023  integrase catalytic subunit  90.34 
 
 		 822 bp  617  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1950  integrase core subunit  82.87 
 
 		 690 bp  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00677093  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1888  integrase core subunit  82.87 
 
 		 708 bp  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0919  putative transposase protein  82.87 
 
 		 708 bp  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0554  integrase core subunit  82.87 
 
 		 555 bp  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02984  integrase core domain protein  86.26 
 
 		 702 bp  117  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0982  integrase core subunit  92.31 
 
 		 453 bp  107  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0728789  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1197    92.96 
 
 		 381 bp  101  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1776  integrase core subunit  80.98 
 
 		 822 bp  97.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000934851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1595  integrase core subunit  80.98 
 
 		 870 bp  97.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2611  integrase catalytic subunit  91.55 
 
 		 552 bp  93.7  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.176576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0893  transposase  80.23 
 
 		 177 bp  73.8  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252263  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7359  putative transcriptional regulator  84.78 
 
 		 489 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4106    84.78 
 
 		 105 bp  71.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.412699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2227  insertion element hypothetical protein  79.88 
 
 		 177 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00152933  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0981  integrase core subunit  86.96 
 
 		 285 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0541  putative transposase integrase  94.74 
 
 		 1140 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3643  putative transposase  94.74 
 
 		 1140 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4261  putative transposase  94.74 
 
 		 1140 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.234878 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4350  putative transposase  94.74 
 
 		 1140 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4349  putative transposase  94.74 
 
 		 1140 bp  60  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.732851  normal  0.302741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1309  integrase catalytic subunit  83.95 
 
 		 813 bp  58  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0960  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1134 bp  48.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.176144  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3415  hypothetical protein  91.67 
 
 		 621 bp  48.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1059  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0004  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0575577 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0070  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088066 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0185  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213513 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0549  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151699  normal  0.0449666 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0571  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23921  normal  0.0300939 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0587  ISMca2 transposase OrfB  96.43 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>