41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4134 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4134  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  80.82 
 
 		 548 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  80.82 
 
 		 548 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  80.82 
 
 		 548 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  72.6 
 
 		 594 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  47.7 
 
 		 562 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  47.7 
 
 		 562 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  51.35 
 
 		 562 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  47.7 
 
 		 562 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  50.34 
 
 		 566 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0416  hypothetical protein  45.74 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.607955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  30.86 
 
 		 526 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  30.86 
 
 		 532 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  30.86 
 
 		 532 aa  84.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1955  transposase  36.24 
 
 		 578 aa  84.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  35.57 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0958  transposase  35.57 
 
 		 578 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  34.42 
 
 		 538 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  34.42 
 
 		 538 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  34.42 
 
 		 538 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  34.42 
 
 		 538 aa  82.4  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  34.21 
 
 		 558 aa  77.4  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 		 579 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 		 558 aa  75.9  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 555 aa  71.6  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  32.26 
 
 		 586 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 540 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  37.01 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  33.13 
 
 		 566 aa  61.6  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 596 aa  60.5  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0410  transposase IS4 family protein  25.13 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.18418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1507  hypothetical protein  30.47 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.537606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  29.86 
 
 		 449 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1833  hypothetical protein  31.73 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  28.74 
 
 		 563 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  27.22 
 
 		 547 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  27.22 
 
 		 548 aa  44.3  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  30.5 
 
 		 559 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>