60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3594 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3594  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.668123  normal  0.602516 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4209  acyltransferase  85.67 
 
 
392 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3457  acyltransferase 3  70.32 
 
 
384 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0914284  normal  0.537431 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3723  hypothetical protein  70.32 
 
 
384 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2593  hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  116  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.110945  normal  0.12741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4628  hypothetical protein  31.2 
 
 
401 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0357497  hitchhiker  0.00905511 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2382  acyltransferase family protein  30.08 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0626  acyltransferase  29.7 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1572  acyltransferase 3  31.36 
 
 
409 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.653564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2521  acyltransferase family protein  30.59 
 
 
354 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6708  acyltransferase 3  30.08 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0119  hypothetical protein  24.09 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0158514  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1867  acyltransferase-like protein  27.03 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0282967  hitchhiker  0.0000000000000352917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2535  acyltransferase family protein  24.68 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000282042  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0104  hypothetical protein  26.18 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.402195  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0415  hypothetical protein  32.34 
 
 
233 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0424299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  38.71 
 
 
369 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  38.71 
 
 
369 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  29.21 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1009  acyltransferase 3  40.57 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0379524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.36 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.36 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.36 
 
 
407 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4669  acyltransferase 3  28.79 
 
 
485 aa  56.2  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53122  normal  0.609276 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01696  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08520)  25.06 
 
 
547 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0457343  normal  0.0488755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.61 
 
 
356 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  28.4 
 
 
357 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  38.2 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1463  acyltransferase family protein  20.29 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00510257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1490  acyltransferase family protein  19.83 
 
 
397 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00352289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1608  acyltransferase family protein  19.83 
 
 
397 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533294  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3901  acyltransferase 3  27.57 
 
 
381 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.970511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5835  acyltransferase 3  27.57 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  27.81 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1677  acyltransferase family protein  24.43 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0731  acyltransferase 3  25.95 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.328082  normal  0.588415 
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_02  acetyltransferase  23.58 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.578404  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  23.88 
 
 
640 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  26.52 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0988  hypothetical protein  28.87 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152683  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  27.63 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2240  acyltransferase 3  25.95 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  27.6 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0781  acyltransferase 3  23.96 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  39.36 
 
 
370 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  40.26 
 
 
419 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4105  hypothetical protein  31.4 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0989056  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1540  transferase transmembrane protein  27.12 
 
 
404 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0294492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  36.99 
 
 
398 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  37.65 
 
 
346 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1343  acyltransferase family protein  21.03 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157153  normal  0.361188 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1095  acyltransferase 3  22.79 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  32.67 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0747  acyltransferase 3  31.71 
 
 
316 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  37.23 
 
 
366 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0644  acyltransferase 3  37.84 
 
 
397 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  31.48 
 
 
357 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11061  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
476 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.101379  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  29.06 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.43 
 
 
377 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>