16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3511 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3511  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161904  normal  0.581305 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3392  resolvase domain-containing protein  67.17 
 
 		 689 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4640  recombinase  33.46 
 
 		 689 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4704  recombinase  33.46 
 
 		 689 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.172912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0415  recombinase  33.46 
 
 		 689 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.030164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3901  recombinase  31.58 
 
 		 689 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4918  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 689 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.79279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3420  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 689 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.408833  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4395  resolvase-like protein  32.33 
 
 		 617 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0165  excisionase/Xis, DNA-binding  28.95 
 
 		 685 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8022  hypothetical protein  36.15 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8272  insertion sequence ATP-binding protein  39.74 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.675942  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7609  resolvase domain-containing protein  25.09 
 
 		 690 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.918322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3290  resolvase domain-containing protein  22.91 
 
 		 579 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0458  resolvase domain-containing protein  25.58 
 
 		 722 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2470  recombinase  30.99 
 
 		 100 aa  42  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>