107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2600 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2600  flagellar basal body rod protein FlgB  100 
 
 
127 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000530741 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2992  flagellar basal body rod protein FlgB  77.17 
 
 
127 aa  201  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1331  flagellar basal body rod protein FlgB  75.59 
 
 
127 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.754656  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2110  flagellar basal body rod protein FlgB  46.56 
 
 
129 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.132503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3247  flagellar basal body rod protein FlgB  47.62 
 
 
126 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2965  flagellar basal body rod protein FlgB  39.53 
 
 
129 aa  102  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.157354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4198  flagellar basal body rod protein FlgB  44 
 
 
117 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5538  flagellar basal body rod protein FlgB  35.66 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2570  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.25 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5155  flagellar basal body rod protein FlgB  34.78 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1366  flagellar basal body rod protein FlgB  35.2 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2235  flagellar basal body rod protein FlgB  35.66 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1938  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.57 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.276304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5497  flagellar basal body rod protein FlgB  35.4 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0469396  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0255  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3777  flagellar basal body rod protein FlgB  35.34 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0109555  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0298  flagellar basal body rod protein FlgB  32.2 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2608  flagellar basal body rod protein FlgB  32.59 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0696754  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0024  flagellar basal body rod protein FlgB  32.79 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4411  flagellar basal body rod protein FlgB  34.38 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2831  flagellar basal body rod protein FlgB  31.11 
 
 
138 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0664971  normal  0.159517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3673  flagellar basal body rod protein FlgB  31.03 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3437  putative flagellar basal-body rod protein FlgB  32.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1693  flagellar basal body rod protein FlgB  31.58 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.235256  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2638  flagellar basal body rod protein FlgB  30.37 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1692  flagellar basal body rod protein FlgB  33.61 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315615  normal  0.0176326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1094  flagellar basal body rod protein FlgB  30.25 
 
 
125 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.376721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0596  flagellar basal body rod protein FlgB  32.79 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.244257 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1392  flagellar basal body rod protein FlgB  31.9 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0618  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0896138  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0629  flagellar basal body rod protein FlgB  31.85 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1132  flagellar basal body rod protein FlgB  33.62 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1144  flagellar basal body rod protein FlgB  26.89 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2826  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.68 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0735  flagellar basal body rod protein FlgB  28.8 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01069  flagellar basal-body rod protein B  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2573  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1196  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2527  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.30096  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2055  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.176072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0427  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.75 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707859  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2252  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1452  flagellar basal body rod protein FlgB  30.08 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1217  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.96 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01077  hypothetical protein  30.08 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3656  flagellar basal body rod protein FlgB  30.58 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.306825  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0151  flagellar basal body rod protein FlgB  28.21 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1517  flagellar basal body rod protein FlgB  33.62 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0183705  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1645  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.32 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000413162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3954  flagellar basal-body rod protein FlgB  48.08 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2134  flagellar basal body protein-like protein  28.46 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24000  flagellar basal-body rod protein  28.36 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0342  flagellar basal-body rod protein FlgB  38.1 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395119  normal  0.980929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2176  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.7 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.873568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1954  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.18 
 
 
131 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4212  flagellar basal body rod protein FlgB  29.66 
 
 
126 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1655  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0922245  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0237  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0135  flagellar basal body rod protein FlgB  28.81 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0263191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2378  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.36 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0184  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.65 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0140  flagellar basal body rod protein FlgB  39.02 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.933867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1321  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.36 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1587  flagellar basal body rod protein FlgB  27.21 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0317  flagellar basal body rod protein FlgB  24.39 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.763946  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2272  flagellar basal-body rod protein FlgB  35.63 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.240352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3583  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.57 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0676749  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2924  flagellar basal-body rod protein FlgB  39.02 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2000  flagellar basal body rod protein FlgB  35.29 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3794  flagellar basal body rod protein FlgB  38.75 
 
 
164 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0749  flagellar basal-body rod protein FlgB  28.46 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3073  flagellar basal body protein  32.17 
 
 
150 aa  43.5  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.179869 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1637  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.65 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1102  flagellar basal body rod protein FlgB  31.33 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0520  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.68 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.223496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2350  flagellar basal-body rod protein FlgB  30.43 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4791  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.04 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1271  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0101569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1286  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.468061  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1242  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.217975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2014  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2198  flagellar basal body rod protein FlgB  27.69 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000944408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0349  flagellar basal body rod protein FlgB  22.76 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0740426 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3714  flagellar basal-body rod protein FlgB  37.04 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.202019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3734  flagellar basal body rod protein FlgB  33.33 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0266  flagellar basal-body rod protein FlgB  33.94 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0762  flagellar basal-body rod protein FlgB  34.58 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2598  flagellar basal body rod protein FlgB  25.2 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.171228  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1868  flagellar basal body rod protein FlgB  25.2 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1465  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.09 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1597  flagellar basal body rod protein FlgB  26.96 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1345  flagellar basal body rod protein FlgB  28.28 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1124  flagellar basal-body rod protein FlgB  26.36 
 
 
127 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1647  flagellar basal-body rod protein FlgB  31.73 
 
 
116 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.938182  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4524  flagellar basal body rod protein  51.28 
 
 
119 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.996777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1553  flagellar basal-body rod protein FlgB  30 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.809609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1525  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.13 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1419  flagellar basal-body rod protein FlgB  29.75 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1340  flagellar basal body rod protein FlgB  28.3 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>