More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1199 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
380 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  83.33 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  83.07 
 
 
380 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  64.12 
 
 
377 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 
387 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.68 
 
 
384 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
395 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 
414 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 
414 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
395 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
422 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.29 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 
378 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.09 
 
 
384 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  36.8 
 
 
395 aa  207  2e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
414 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  36.88 
 
 
413 aa  197  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
393 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.99 
 
 
402 aa  173  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.11 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.1 
 
 
382 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.68 
 
 
397 aa  171  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
407 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.6 
 
 
396 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0599  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 
393 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.155589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
382 aa  156  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
389 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.08 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.92 
 
 
382 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  31.92 
 
 
382 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.57 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.42 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.57 
 
 
400 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.82 
 
 
384 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.01 
 
 
387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.38 
 
 
872 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.03 
 
 
400 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  32.02 
 
 
395 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
400 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  31.99 
 
 
395 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.98 
 
 
382 aa  132  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 
418 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.335105  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  31.99 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.44 
 
 
383 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  31.99 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  31.99 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 
395 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5121  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.59 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493266  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2470  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.5015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02110  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  31.7 
 
 
887 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.68 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  32.92 
 
 
395 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2398  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.55 
 
 
391 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  32.92 
 
 
395 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  32.92 
 
 
395 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  32.92 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.63 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0611  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.56 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  31.37 
 
 
395 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.05 
 
 
388 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0537  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.95 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  27.22 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0053  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  33.45 
 
 
880 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00824493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  26.85 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  32.92 
 
 
395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  32.67 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3657  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.44 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  32.67 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.25 
 
 
384 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.57 
 
 
382 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.11 
 
 
398 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3383  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 
378 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469103  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
377 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
371 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  32.45 
 
 
383 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  32.45 
 
 
383 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.83 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2054  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
391 aa  126  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000013313  hitchhiker  0.0000000115511 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0105  alcohol dehydrogenase  33.83 
 
 
408 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.535582  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
399 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
383 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.73 
 
 
382 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>