More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3408 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 352 aa  692    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.32 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 1035 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.97 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 		 338 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 326 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 333 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  50.94 
 
 		 342 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.91 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.91 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.27 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.78 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 398 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.06 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 274 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 353 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  44.96 
 
 		 300 aa  92.8  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 		 544 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 		 310 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 573 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 663 aa  90.1  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 455 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  45.08 
 
 		 336 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 314 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.54 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 235 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 1250 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 		 256 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  42.02 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 244 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  33.52 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 		 597 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.3 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  48.08 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  43.4 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.82 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  33.59 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  31.03 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  28.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  45.22 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  28.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 983 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 		 581 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  40.65 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.03 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.52 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 		 266 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  31.16 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  42.39 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 		 727 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  25 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.14 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  45.36 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>