More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2837 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
129 aa  262  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  73.44 
 
 
131 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  71.88 
 
 
131 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  72.44 
 
 
129 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  70.31 
 
 
131 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  68.99 
 
 
128 aa  189  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  70.08 
 
 
127 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  70.87 
 
 
127 aa  188  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  70.08 
 
 
127 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  70.87 
 
 
127 aa  188  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  70.87 
 
 
127 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  71.09 
 
 
131 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  70.31 
 
 
131 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  70.08 
 
 
127 aa  186  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  71.09 
 
 
131 aa  185  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1718  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  69.37 
 
 
114 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123657  normal  0.330676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  153  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
188 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  60 
 
 
126 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  57.72 
 
 
129 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  58.06 
 
 
131 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  59.68 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  56.91 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
128 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
131 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  60.83 
 
 
126 aa  150  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  56.91 
 
 
129 aa  150  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  58.87 
 
 
127 aa  150  8e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
131 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
127 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  57.26 
 
 
131 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 
131 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  56.1 
 
 
129 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  56.1 
 
 
129 aa  148  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  53.97 
 
 
137 aa  148  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
135 aa  148  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
128 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
127 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
127 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  58.06 
 
 
127 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  56.1 
 
 
129 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  57.26 
 
 
127 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  60 
 
 
123 aa  147  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  55.28 
 
 
129 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  56.45 
 
 
139 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
124 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  57.6 
 
 
133 aa  147  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  58.33 
 
 
126 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  56.91 
 
 
128 aa  147  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  58.33 
 
 
124 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  57.26 
 
 
128 aa  146  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  54.76 
 
 
131 aa  146  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  55.28 
 
 
129 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  59.17 
 
 
123 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  55.28 
 
 
128 aa  146  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2289  chemotaxis protein CheY  57.5 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  54.47 
 
 
148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  56.45 
 
 
128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  56.2 
 
 
132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2010  response regulator receiver protein  56 
 
 
126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  60 
 
 
131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  55.2 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  57.02 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  55.12 
 
 
126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  55.65 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>